Mặc dù đã được một năm kể từ khi câu lạc bộ bơi lội của trường trung học Iwatobi được thành lập, nhưng các thành viên mới vẫn chưa tham gia câu lạc bộ. Bây giờ Haruka Nanase và Makoto Tachibana là học sinh cuối cấp, cùng với những người bạn nhỏ tuổi Nagisa Hazuki và Rei Ryuugazaki, họ phải tìm cách thu hút thành viên mới. Nếu không, câu lạc bộ sẽ buộc phải đóng cửa vào năm sau do thiếu thành viên.